O conhecimento sobre a diversidade biológica de Moçambique ainda é escasso. Largas áreas do país ainda não foram inventariadas, receberam pouquíssimos inventários ou então os seus resultados ainda não foram colocados à disposição da comunidade científica e público em geral. Estas lacunas de conhecimento constituem um importante desafio para os processos de tomada de decisão para a conservação da biodiversidade no país, principalmente considerando a elevada busca de espaço para implantação de actividades produtivas. Com vista a contribuir para o melhoramento dos processos de tomada de decisão na interface entre conservação e desenvolvimento, este artigo apresenta uma revisão dos dados e estudos existentes sobre a biodiversidade de Moçambique e faz o levantamento dos principais desafios à conservação da diversidade biológica de Moçambique. Os resultados indicam a predominância de estudos sobre as espécies terrestres, com destaque para mamíferos e aves, sendo maioritariamente desenvolvidos por equipas de pesquisa estrangeiras. Por outro lado, os resultados apontam que o desflorestamento, a exploração mineira, a agricultura e as espécies invasoras são as principais ameaças à conservação da biodiversidade em Moçambique. Deste modo, recomenda-se um esforço no incremento dos estudos/ levantamentos da biodiversidade do país e a gestão dos processos de desenvolvimento territorial para salvaguardar o habitat e a persistência das espécies no país.